Conflictul dintre Traian Basescu si procurorii din cadrul Parchetului National Anticoruptie a fost -stins-, actualul presedinte promitand ca va garanta independenta acestei institutii. Aflat in vizita la PNA, care si-a prezentat bilantul pentru anul 2004, presedintele Traian Basescu a precizat ca a dorit sa fie prezent la bilantul institutiei pentru a da acest mesaj de incredere procurorilor.
Lecturand raportul PNA, el a ajuns la concluzia ca aceasta este o institutie tanara, care a acumulat si care va fi in masura sa serveasca interesul pentru care a fost creata. Traian Basescu a mai spus ca, in discutia cu procurorii PNA, a subliniat faptul ca Romania are o mare problema in privinta aderarii, in ianuarie 2007, la Uniunea Europeana, legata de modul de functionare al justitiei si de capacitatea institutiilor statului roman de a lupta, eficient, impotriva coruptiei, in special a coruptiei la nivel inalt. Sedinta de bilant a PNA a avut loc cu usile inchise, presa neavand voie sa paraseasca un perimetru bine delimitat si aparat de angajatii SPP. Pentru a arata ca a vorbit serios atunci cand a declarat ca nu are resentimente fata de procurorii care l-au anchetat, la inceputul sedintei, Traian Basescu a dat mana si cu Gheorghe Draghici, unul dintre procurorii care au instrumentat dosarul Flota.