SUA ar putea rata ocazia de a-i judeca pe teroriștii de la 11 septembrie și pe cei de la Guantanamo, din cauza torturilor la care aceștia au fost supuși în centrul de detenție. Un oficial al Pentagonului, Susan Crawford, a recunoscut public că sauditul Mohammed al-Qahtani, bănuit că ar fi unul dintre atentatorii sinucigași care au intrat cu avioanele în Turnurile Gemene la 11 septembrie 2001, a fost torturat de armata americană. Qahtani a încercat să intre în SUA cu o lună înainte de atacuri, când intenționa să devină al 20-lea pirat al aerului, dar accesul i-a fost interzis, fiind prins în 2002 în Afganistan și închis la Guantanamo, unde a fost supus la tratamente rele. Acesta este și motivul invocat de Crawford pentru renunțarea la acuzații, tortura având consecințe de ordin medical asupra sauditului, din cauza formei prea agresive și abuzive folosite. FBI pare însă să aibă dovezi că acesta l-a contactat pe Mohammed Attah la sosirea în Miami, fapt ce ar putea permite aducerea sa în fața instanței federale, dar judecătorul ar putea să îl pună sub îngrijiri psihiatrice, din cauza torturilor îndurate. Pe lângă acest caz, mărturisirile de la Pentagon ar putea împiedica condamnarea celor cinci persoane suspectate de organizarea atacurilor de la 11 septembrie. Khaled Sheikh Mohammed, care susține că a organizat atacurile, și alte două persoane au fost supuse la simularea înecului, potrivit vicepreședintelui Dick Cheney, posibilitatea judecării și a unei condamnări la o Curte clasică rămânând incerte. Un alt oficial a declarat că mijloacele de interogare descrise erau legale în 2002-2003, dar acum nu mai sunt permise. Mărturisirea lui Crawford este pusă sub semnul întrebării de oficiali de la Pentagon, în contextul în care vine cu o săptămână înainte de învestirea lui Obama, bănuindu-se că s-ar teme de urmăriri juridice împotriva administrației Bush.
